为了获知基因序列在功能和结构上的相似性,经常需要将几条不同序列的DNA进行比对,以判断该比对的DNA是否具有相关性。
现比对两条长度相同的DNA序列。定义两条DNA序列相同位置的碱基为一个碱基对,如果一个碱基对中的两个碱基相同的话,则称为相同碱基对。接着计算相同碱基对占总碱基对数量的比例,如果该比例大于等于给定阈值时则判定该两条DNA序列是相关的,否则不相关。
有三行,第一行是用来判定出两条DNA序列是否相关的阈值,随后2行是两条DNA序列(长度不大于500)。
若两条DNA序列相关,则输出“yes”,否则输出“no”。
0.85 ATCGCCGTAAGTAACGGTTTTAAATAGGCC ATCGCCGGAAGTAACGGTCTTAAATAGGCC
yes